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如何使用ncbi搜索並下載基因序列

基因的全序列是麼? OK 進入NCBI,選中mapview選擇項。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/ 輸入你要下載的基因名稱和物種。 舉個例子,我要下載小鼠的IGF2基因。 先在下拉菜單中選mus musculus(小鼠的拉丁文), for後面填寫IGF2基因(你要

NCBI是生物學科經常使用的搜索引擎,其收納了大量的基因和蛋白序列,可以對這些序列進行比對、設計引物等,功能非常強大。接下來以下載H9亞型流感病毒HA基因為例為大家介紹如何使用NCBI搜索並下載基因序列。

如何使用ncbi搜索並下載基因序列

方法

利用瀏覽器搜索NCBI,點擊進入官網。

打開ncbi網頁,在最上面的搜索框旁邊的下拉條選擇nucleotide,輸入MC1R(有時候需要寫全稱比較準),點擊“search".然後可以看到搜索到的網頁的右上角有:Top Organisms [Tree],再點擊那個”Tree",可以看到分類羣的各種不同種屬的數據。點哪個種

如何使用ncbi搜索並下載基因序列 第2張

進入官網後在欄目內選擇“Nucleotide”,搜索欄內輸入“Avian influenza virus H9 HA”,輸入完畢後點擊“search”。

OMIM數據庫之父Victor Almon McKusick先生是位臨牀醫生。該數據庫的最原始的版本是一本叫MIM的遺傳學書籍,後來挪到了網上,就加了一個“O”稱為在線的人類孟德爾遺傳學。所以OMIM數據庫不同於其他的NCBI數據庫。其設計之初是為臨牀醫生提供在線瀏

如何使用ncbi搜索並下載基因序列 第3張

新的頁面會顯示許多關於“Avian influenza virus H9 HA”的基因序列,如果其中的一個符合你的要求,就在它序列前的方框打勾即可。也可以根據自身需求繼續在搜索條內添加限定,比如添加“2010”,即2010年分離到的病毒。

我現在的文件裏有幾百個基因的ID(EntrezID),怎樣去下載這些ID對應的基因fasta格式的序列?NCBI裏有Batchentrez,但是需要的是accession和GI號,我轉換完ID之後,都是一

如何使用ncbi搜索並下載基因序列 第4張

選定目的基因序列後,點擊界面右上角的“send to”,在“choose destination”中選擇“file”,在“format”中選擇“FASTA”,最後點擊“create file”即可將序列下載到自定義文件夾。

GenBank同二樓説的,還有DDBJ、EMLB,是世界三大核酸數據庫,三者各有優缺點,如果要完整菌種的序列,你可以將三者結合使用,希望幫到你。

如何使用ncbi搜索並下載基因序列 第5張

下載完畢後打開所在文件夾就能看到基因序列了。

小鼠的可以下載,牛的恐怕暫時還沒有 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide/mouse/

如何使用ncbi搜索並下載基因序列 第6張

擴展閲讀,以下內容您可能還感興趣。

我想在NCBI上下載特定物種的Sox21基因的序列?要怎麼操作?

這裏zd:內容

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=Sox21更多追問追答追問我是想下載它的序列,就是ATGC的那些東西。追答  你可以點擊那些鏈接啊,或者你説具體點,你需要那個物種的SOX21,要cDNA還是基因組DNA。追問我沒發現連接裏面有具體的序列呀?,要基因組DNA追答哪個物種的基因組DNA的SOX21?追問老鼠,人,猩猩,狗都行追答  1. 點下面這個鏈接:

http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgc?hgsid=332929391&g=refGene&i=NM_007084&c=chr13&o=95361878&l=95361878&r=95364389&db=hg19

2. 往下拉,點這個地方:Genomic Sequence from assembly,就來到如下頁面:

http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgc?hgsid=332929391&g=htcGeneInGenome&i=NM_007084&c=chr13&l=95361878&r=95364389&o=refGene&table=refGene

3. 選擇好上下游長度,以及其它選項,往下拉,點submit:

你試試看。追問能加下QQ説麼?我QQ402758327追答沒有用過QQ。

如何在NCBI上尋找果蠅的所有基因名稱,並下載。

建議直接看ncbi 網站説明。知道序列號就可以輕鬆找到該基因了。一個序列號一般對因一個基因呀 !也可用序列隊序列比對法直接找一下

我英文不好,誰能教下怎麼從NCBI上下載真核原核生物基因序列,具體點

打開NCBI網站知,在search中選擇Nucleotide核酸序列,後面輸入你想找序列的拉丁文,搜索,點擊道序列,選着fasta格式,在上方中間位專置send選擇file,create file 就下載下來了,可以屬以記事本格式打開

GenBank Release146(http://www.ncbi.nih.gov/Genbank/)基因序列怎麼下載的

首先,你的網址就不zhidao對,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/其次,選擇數據庫,輸入你版的基因編號,搜索,然後下載權。追問這個

Release146

怎麼下的?

從ncbi下載的全基因組序列壓縮包是FNA格式 不能解壓怎麼辦

通常下載基因組序列是fasta或者text格式,用電腦自帶的筆記本軟件就能打開,沒見過下載壓縮包這麼麻煩的。

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