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t載體怎麼用

1.T載體如何製備

用限制性內切酶製備T載體 陸哲明,柯 楊△[北京大學臨牀腫瘤學院(北京市腫瘤防治研究所)遺傳室,北京 100034] [關鍵詞]T載體;DNA限制酶類;遺傳載體;基因擴增[摘 要] 目的:介紹一種製備T載體的方法。

t載體怎麼用

方法:用限制性內切酶XcmⅠ酶切,在兩端產生T末端,製備的T載體可直接用來克隆用TaqDNA聚合酶產生帶A末端的PCR產物。結果:PCR產物直接和T載體連接,用常規氯化鈣法制備的感受態菌轉化,對轉化子提取質體進行酶切鑑定,證明陽性率達80%。

結論:製備T載體過程簡單,質量穩定,產量高,並可擴增等優點。[中圖分類號]Q342 [文獻標識碼]A [文章編號]1671 167X(2002)06 0726 03 PCR是目前體外DNA擴增最常用的方法,對PCR產物進行快速有效的克隆是開展下游許多實驗所要求的。

目前TA克隆是一種快速的,一步到位地把PCR產物直接插入到質體載體的方法。而商品化的TA克隆系統由於售價高,質量批次間不穩定且無法進行循環使用等缺點,在實際應用中,限制了T載體的廣泛使用。

本文介紹了一種簡單、高效,可在普通實驗室中製備並可反覆擴增的T載體制備方法,並經PCR產物克隆,酶切鑑定,得到了非常理想的結果。1 材料與方法1.1 製備SuperpGEM Teasy載體(簡稱pSP Teasy載體)1.1.1 製備pSP Teasy環化載體 以線性化的pGEM Teasy載體(Promega為模板,兩邊設計引物:F: HindⅢ XcmⅠG AATTCGCG R: HindⅢ XcmⅠC CGCGGCCGCCA 引物的5′端各插入HindⅢ和XcmⅠ位點,3′端與模板互補,在PfuDNA聚合酶的作用下擴增,擴增產物經HindⅢ酶切後,自身環化,挑選能被HindⅢ酶切的克隆即為陽性克隆,經測序進一步證實。

1.1.2 製備pSP Teasy線性化載體 按照標準酶切體系,用XcmⅠ(NEB)酶切,酶切產物經瓊脂糖凝膠電泳後,玻璃奶回收,測量吸光度值(D260),調整質量濃度至50mg·L-1,此載體可直接用於克隆。3 討論PCR技術是目前體外擴增DNA最常用的方法。

有時需得到克隆化的DNA以便於雜交分析、高質量測序及從複雜PCR產物中分離目的片段。常用的方法有非定向克隆和定向克隆。

定向克隆需在引物5′端引入限制性內切酶位點,PCR產物經適當內切酶酶切後產生粘端,連接到相應載體。非定向克隆有兩種策略,一種是平末端克隆,在klenow和T4DNA聚合酶作用下修平PCR產物末端,但連接效率僅為粘端連接的1/50,且自身環化率高[1];另一種是TA克隆。

TA克隆是一種快速的,一步到位的非定向克隆法,可以把PCR產物直接插入到質體載體。TA克隆系統利用TaqDNA聚合酶的末端轉移酶活性,在擴增DNA3′末端非模板依賴地加上一個核苷酸,通常為腺苷酸[2]。

這個3′A突出端被用於把PCR產物插入到插入位點有一個3′T突出端的載體。製備好的載體,其關鍵部分是帶有3′T突出端的線性分子。

目前製備3′T載體的方法是先用平末端限制性內切酶(如EcoRⅤ)酶切載體,再用TaqDNA聚合酶在僅有dTTP的情況下,72~75℃反應,在3′末端添加一個T[1,3]。但是,實際反應過程中,由於3′末端加T為非優先聚合核苷酸,僅部分的3′端可添加T,或者有少量可能添加一個以上T,造成載體在克隆過程中自身環化高,必然增加篩選陽性克隆的難度。

另外,每次生產T載體產量有限(一般為1μg),不適於大規模生產,造成批次間質量差異大。即使商品化TA克隆試劑盒也存在陽性率低和質量不穩定的缺點。

因其價格昂貴,並且無法進行循環使用,在普及上存在一定困難。利用限制性內切酶製備T載體利用限制性內切酶特異性強,一次酶切產量高,質量穩定,易於操作等特點。

在內切酶家族中,有一類稱可變酶,它們的識別序列中的一個或幾個核苷酸是可變的,如本文采用的XcmⅠ,它識別序列見圖3a,在構建pSP Teasy載體時,利用其中間序列可變,在靠近T7啟動子端,設計了XcmⅠ的識別序列見圖3b,而在靠近SP6啟動子端XcmⅠ的識別序列見圖3c,這樣在XcmⅠ酶切後,其剩餘的序列如圖1,在3′端分別產生T。經查NewEnglandBiolabs公司的目錄,符合上述特徵的酶列於表1。

我們在兩個XcmⅠ之間引入HindⅢ位點有下列優點:(1)在構建pSP Teasy時提供方便;(2)經HindⅢ酶切後,可以防止載體中的XcmⅠ位點不完全酶切造成的自身環化;(3)兩個XcmⅠ位點之間,提供保護的鹼基,便於XcmⅠ酶切。用於克隆的PCR產物在連接前需經瓊脂糖凝膠電泳,如條帶鋭利,則一般無需純化即可直接用於連接;如產物有非特異擴增或引物二聚體濃度較高,最好先用低熔點膠或玻璃奶法純化。

如果擴增用具有保真功能的聚合酶,如PfuDNA聚合酶、PwoDNA聚合酶或TliDNA聚合酶,由於它們有3′~5′的外切酶活性,則PCR產物為平末端,需經純化後用TaqDNA聚合酶在dATP存在下72℃加腺苷酸尾15~30min,即可達到相同效果。插入片段(PCR產物)與載體摩爾比一般要求在3∶1~1∶3之間,但按筆者經驗,摩爾比不經優化亦可產生較好克隆效果,可能與pSP 。

2.什麼是T載體

T載體又稱T-vector。聚合酶鏈反應產物的克隆運載體,線性化後兩側3′端各多出一個去氧胸苷酸(T)。由於PCR產物兩側3′端通常含單個去氧腺苷酸(A),與T載體之間的A-T互補性可提高PCR產物克隆的效率。

T載體是一種克隆載體,也就是用於在受體細胞中進行目的基因擴增的載體,它不能大量表達。多用於克隆PCR產物,一般用一些常見的載體改造成的,一般的DNA聚合酶沒有3'-5'核酸外切酶活性,即酶的校正活性,在PCR產物3'末端以非模板依靠方式加上一個腺苷酸殘基(A),這樣PCR產物的3'腺苷酸可和T-載體的3'胸腺嘧啶 互補,T-載體系統進行有效連接的基礎正是這種鹼基配對作用。相反,有校正活性的聚合酶將移去這個3' 突出端,產生平端PCR產物,這種產物不能直接用T-載體系統進行克隆。

假如想要一PCR擴增基因的產物大量表達,常見的方法是先將PCR產物連入T載體擴增(所用T載體需事先設計好酶切位點),再用相應酶切下目的片段,然後連入以同樣酶切處理後的表達載體大量表達蛋白質。

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